پژوهشکده علوم گیاهی دانشگاه فردوسی شامل سه گروه پژوهشی گیاه شناسی ( هرباریوم)، بقولات و گیاهان زینتی است و  آزمایشگاه های مختلف، بانک بذر و سردخانه از جمله بخشهای این پژوهشکده است. این واحد تاکنون با سازمانها  و موسسه هایی مانند وزارت جهاد کشاورزی شامل سازمان جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات کشاورزی و مراکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی برخی استانها، سازمان حفاظت محیط زیست، پارک های علم و فناوری و… همکاری نزدیک و پیوسته ای داشته است.